1、作為軟件得到重點保護的依據(jù)

《國務(wù)院〈鼓勵軟件產(chǎn)業(yè)和集成電路產(chǎn)業(yè)發(fā)展若干政策〉的通知》第三十二條規(guī)定：“國務(wù)院著作權(quán)行政管理部門要規(guī)范和加強軟件著作權(quán)登記制度，鼓勵軟件著作權(quán)登記，并依據(jù)國家法律對已經(jīng)登記的軟件予以重點保護。”

2、作為稅收優(yōu)惠的依據(jù)

根據(jù)《國務(wù)院〈鼓勵軟件產(chǎn)業(yè)和集成電路產(chǎn)業(yè)發(fā)展若干政策〉的通知》及財政部、國家稅務(wù)總局的相關(guān)文件，國家對已經(jīng)登記的軟件將會予以重點保護，并享受有關(guān)稅收、知識產(chǎn)權(quán)、融資、進出口、人才吸引等若干的優(yōu)惠政策。

3、作為技術(shù)出資入股

《關(guān)于以高新技術(shù)成果出資入股若干問題的規(guī)定》規(guī)定計算機軟件可以作為高新技術(shù)出資入股，而且作價的比例可以突破公司法20%的限制達到35%。現(xiàn)在有的地方更規(guī)定軟件可以作價100%以技術(shù)出資的規(guī)定。不過一般都要求軟件著作權(quán)應(yīng)當(dāng)取得登記。

4、作為申請科技成果的依據(jù)

科學(xué)技術(shù)部關(guān)于印發(fā)《科技成果登記辦法》的通知第八條規(guī)定：“辦理科技成果登記應(yīng)當(dāng)提交《科技成果登記表》及下列材料：(一)應(yīng)用技術(shù)成果：相關(guān)的評價證明(鑒定證書或者鑒定報告、科技計劃項目驗收報告、行業(yè)準入證明、新產(chǎn)品證書等)和研制報告;或者知識產(chǎn)權(quán)證明(專利證書、植物品種權(quán)證書、軟件登記證書等)和用戶證明。”這里的登記可以理解為著作權(quán)的登記，其他部委也有類似規(guī)定，以軟件申請技術(shù)成果應(yīng)當(dāng)遞交軟件登記證書。

除此之外，軟件著作權(quán)登記還有更為現(xiàn)實的意義，就是享有軟件著作權(quán)證明作用。軟件由一系列的代碼組成，稱為源代碼，其可以無限制的復(fù)制。軟件著作權(quán)所保護的是源代碼，一般認為誰持有源代碼，誰即是著作權(quán)人。由于源代碼的可復(fù)制性，不象復(fù)制紙質(zhì)材料那樣可以區(qū)分原始與復(fù)制件，假使源代碼保密不嚴，就很難區(qū)分著作權(quán)人。如果盡早進行著作權(quán)登記，取得《軟件著作權(quán)登記證書》，這就是初步的權(quán)利證明，在發(fā)生軟件著作權(quán)爭議時，《軟件著作權(quán)登記證書》是主張軟件權(quán)利的有力武器，同時是向人民法院提起訴訟、請求司法保護的最好證據(jù)，而對方要證明《軟件著作權(quán)登記證書》并非真正軟件著作權(quán)人，在舉證上具有相當(dāng)大的難度。在進行軟件著作權(quán)貿(mào)易時，《軟件著作權(quán)登記證書》作為權(quán)利證明，也有利于交易的順利完成。